Signifikanz testen

Fragen, die sich auf kein spezielles Verfahren beziehen.

Signifikanz testen

Beitragvon grizzabella » Mi 18. Apr 2012, 14:03

Hallo zusammen,

erstmal ich weiß nicht genau, in welchem Unterforum ich meine Frage stellen soll, deshalb schreibe ich im allgemeinen Frageteil. Darf aber auch sehr gerne verschoben werden.

Ich schreibe gerade meine Masterarbeit und soll auch Aussagen über die Signifikanz machen. Versuche mal kurz zu erklären, worum es geht.
Ich habe 2 Datensätze: einmal einen Datensatz mit 5455 Genen (keimbahnspezifisch) und einen anderen Datensatz mit 26843 Genen (Gesamtanzahl an Genen eines Wurms). Jedes 4,9te Gen ist also keimbahnspezifisch.

Nun habe ich mir aus dem Gesamtpool an Genen, die signifikant stärksten hoch- und runterregulierten Gene herausgesucht und geschaut, wie viele Treffer ich mit den 5455 keimbahnspezifischen Genen habe. 392 Gene sind signifikant runterreguliert, davon gibt es 78 gemeinsame Treffer. Das heißt, jedes 5te Gen ist ein Treffer (392/78). 211 Gene sind signifikant hochreguliert, davon 34 Treffer. Das heißt, jedes 6,2te Gen ist ein Treffer (211/34). Nun möchte ich wissen, ob dieses Ergebnis signifikant ist. Also ist jedes 5te Gen signifikant im Vergleich zu jedem 4,9ten Gen und ob jedes 6,2te Gen signifikant im Vergleich zu jedem 4,9ten Gen ist. Hoffe, das ist verständlich ausgedrückt.

Habe mit Excel schon einiges ausprobiert, aber nie ein Ergebnis bekommen. Weiß leider auch nicht so wirklich, mit welcher Funktion man dies berechnen kann und hoffe hier nun auf Hilfe für die ich mich auch schon mal recht herzlich bedanken möchte!

LG grizza
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Re: Signifikanz testen

Beitragvon PonderStibbons » Mi 18. Apr 2012, 14:56

Du willst vergleichen die Raten keimbahnspezifischer Gene
bei hochregulierten, heruterregulierten, und den sonstigen
(ein Vergleich Teilgruppe/Gesamtgruppe ist übrigens nicht
durchführbar) Genen ? Falls ja, wäre das über eine Kreuztabelle
der 3 Regulations-Gruppen versus Merkmal keimbahnspezifisch/
nicht keimbahnspezifisch und Chi² Test machbar. Kreuztabelliert
werden dabei einfach die Ausgangs-Häufigkeiten.

Mit freundlichen Grüßen

P.
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Re: Signifikanz testen

Beitragvon grizzabella » Mi 18. Apr 2012, 15:57

Oh je, das klingt irgendwie kompliziert und ich glaube, das ist auch nicht das, was ich machen will. :?

Vielleicht geht es auch gar nicht so, wie ich es mir vorgestellt habe. Ich hab halt gedacht, dass man irgendwie berechnen kann, ob es signifikant ist oder vielleicht besser gesagt (falls man das überhaupt so sagen kann) ob die Differenz signifikant ist. Also wenn in einem Gesamtpool jedes 4,9te Gen keimbahnspezifisch ist und ich in einer Teilmenge des Gesamtpools (=392 am stärksten runterregulierte Gene) 78 keimbahnspezifische Treffer habe, was jedem 5tem Gen entspricht, ob 4,9 vs 5 signifikant ist. Aber wenn ich so drüber nachdenke, müsste man es vielleicht wirklich mit so einer Kreuztabelle machen. Was in meinem Fall dann vielleicht doch zu aufwendig und zu viel Arbeit wäre. Hmmm...

Aber erstmal vielen Dank für deine Hilfe!!
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Re: Signifikanz testen

Beitragvon KoRnfuzius » Mi 18. Apr 2012, 18:18

So habe ich deinen Text verstanden.

-----------------Gesamt --- runterreguliert --- raufreguliert
Gesamt: ------ 26843 ----------- 392 -------------- 211
Spezifisch: ----- 5455 ----------- 78 --------------- 34

Die Kreuztabelle testest du dann auf Gleichverteilung.
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Re: Signifikanz testen

Beitragvon PonderStibbons » Mi 18. Apr 2012, 19:45

Die Anlage stimmt, aber die Spalte "Gesamt" hat da wie gesagt nichts
verloren, weil die beiden anderen Gruppen darinstecken und somit
zweifach vertreten wären. Richtig wäre an dieser Stelle der Rest aus
Gesamtstichprobe minus der beiden anderen Gruppen.

Ferner wird das nicht auf Gleichverteilung getestet (jede Zelle 1/6
der Gesamtstichprobe?), sondern auf Zusammenhang zwischen den
beiden Merkmalen.

Mit freundlichen Grüßen

P.
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Re: Signifikanz testen

Beitragvon grizzabella » Do 19. Apr 2012, 17:41

Hm... ok.

Also sieht meine Datenreihe folgendermaßen aus:

-------------------------runter--------rauf
Rest------21388--------314----------177
spezif.-----5455--------78------------34

Auf Zusammenhang zwischen den Merkmalen testen heißt also Regressionsanalyse.

Habe mir die Daten in Excel als Diagramm anzeigen lassen, da ist ein linearer Zusammenhang vorhanden. Habe dann mit der Funktion RGP (hat mir der Funktionsassistent so ausgespuckt) gerechnet und 0.255364494 als Ergebnis bekommen.

Sagt mir das denn nun was über die Signifikanz aus oder was muss ich nun noch machen?

Sorry, dass ich mich so blöd anstelle, aber mit Statistik stand ich schon immer aufm Kriegsfuß... :?

Viele Grüße, grizza
grizzabella
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Re: Signifikanz testen

Beitragvon PonderStibbons » Do 19. Apr 2012, 18:01

Auf Zusammenhang zwischen den Merkmalen testen heißt also Regressionsanalyse.

Keineswegs. Es ist der Chi² Test zum Zusammenhang
zwischen zwei kategorialen Merkmalen.

Mit freundlichen Grüßen

P.
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