Signifikanz aus Anzahl

Fragen, die sich auf kein spezielles Verfahren beziehen.

Signifikanz aus Anzahl

Beitragvon Stefanie » Fr 20. Mär 2015, 14:51

Halli Hallo,
ich habe eine Frage zur Auswertung meiner Daten. Ich stelle mich wahrscheinlich ziemlich an, doch mit Statistik habe ich leider keinerlei Erfahrung. Bin eben Biologe :lol:
Ich habe täglich Positionen von Proteinen am Mikroskop untersucht. Die Lage der Proteine kann in vier Positionen eingeteilt werden. Die Anzahl der Proteine in den jeweiligen Positionen, als auch die Anzahl der Proteine generell variieren dabei immer. Der Datensatz sieht wie folg aus:

Anzahl der Proteine in den verschiedenen Lagen
1 2 3 4
9.2. 32 27 16 4
10.2. 25 18 5 14
11.2. 30 29 1 4
12.2. 7 5 0 10
15.2. 46 28 2 10
16.2. 70 27 7 20
19.2. 25 22 5 15
22.2. 40 28 6 4
23.2. 10 22 5 12
24.2. 6 14 2 10
2.3. 15 10 8 15
4.3. 20 17 3 1
5.3. 8 7 0 5
9.3. 15 11 2 4
10.3. 43 32 9 13
15.3. 22 26 6 8
16.3. 18 7 1 3
17.3. 21 15 1 8
3.5. 8 8 2 0
7.5. 15 20 2 12
26.5. 29 38 8 12
14.6. 7 12 0 7
summe
512 423 91 191

Ich möchte nun wissen ob meine beobachtete Auswertung der Proteinpositionen (512 Proteine in Position 1; 423 Proteine in Position 2, 91 Proteine in Position 3; 191 Proteine in Position 3) sich signifikant unterscheiden. Ich bin leider total hilflos. Kann ich hier einfach einen t-test machen?
Liebe Grüße und danke im vorraus
Stefanie
Grünschnabel
Grünschnabel
 
Beiträge: 4
Registriert: Fr 20. Mär 2015, 14:43
Danke gegeben: 0
Danke bekommen: 0 mal in 0 Post

Re: Signifikanz aus Anzahl

Beitragvon bele » Fr 20. Mär 2015, 18:07

Hört sich für mich eher nach einem Chiquadrat-Test an. Damit kann man Zähldaten auf Gleichverteilung prüfen.
Code: Alles auswählen
> chisq.test(c(512,423,91,191))

        Chi-squared test for given probabilities

data:  c(512, 423, 91, 191)
X-squared = 379.8283, df = 3, p-value < 2.2e-16

>

Ist nicht gleichverteilt mit p < (hier beliebige sinnvolle Grenze einsetzen)

LG,
Bernhard
----
`Oh, you can't help that,' said the Cat: `we're all mad here. I'm mad. You're mad.'
`How do you know I'm mad?' said Alice.
`You must be,' said the Cat, `or you wouldn't have come here.'
(Lewis Carol, Alice in Wonderland)
bele
Schlaflos in Seattle
Schlaflos in Seattle
 
Beiträge: 5928
Registriert: Do 2. Jun 2011, 23:16
Danke gegeben: 16
Danke bekommen: 1403 mal in 1389 Posts

Re: Signifikanz aus Anzahl

Beitragvon Stefanie » Fr 20. Mär 2015, 19:09

Vielen Dank für die schnelle Antwort.

Was sich mir nur nicht erklärt, wie ich von Gleichverteilung auf die Aussage: "Position 1 ist (nicht) signifikant häufiger vorhanden als Position 2, Position 1 ist (nicht) signifikant häufiger vorhanden als Position 3, Position 1 ist (nicht) signifikant häufiger vorhanden als Position 4....."

Denn so muss ich es in späteren Publikationen formulieren. :oops:

LG,
Steff
Stefanie
Grünschnabel
Grünschnabel
 
Beiträge: 4
Registriert: Fr 20. Mär 2015, 14:43
Danke gegeben: 0
Danke bekommen: 0 mal in 0 Post

Re: Signifikanz aus Anzahl

Beitragvon strukturmarionette » Sa 21. Mär 2015, 01:20

Hi,

du könntest es mit einer einer vierstufigen einfaktoriellen Varianzanalyse und Post-Hoc Tests versuchen.

Gruß
S.
strukturmarionette
Schlaflos in Seattle
Schlaflos in Seattle
 
Beiträge: 4356
Registriert: Fr 17. Jun 2011, 22:15
Danke gegeben: 32
Danke bekommen: 587 mal in 584 Posts

Re: Signifikanz aus Anzahl

Beitragvon bele » Sa 21. Mär 2015, 12:47

Hallo!

Stefanie hat geschrieben:Denn so muss ich es in späteren Publikationen formulieren.


Das stand ja bisher nicht da. Wahrscheinlich ist es am besten, wenn Du Deinen Versuchsaufbau nochmal richtig erklärst und schreibst, was Du willst. Wenn es nur um die Summe in der letzten Zeile geht und wenn Summenbildung über die Tage sinnvoll ist, dann kannst Du Paare von Beobachtungszahlen ebenfalls mit einem Chiquadrattest auf Gleichverteilung prüfen.
Code: Alles auswählen
> chisq.test(c(512, 423))

   Chi-squared test for given probabilities

data:  c(512, 423)
X-squared = 8.4717, df = 1, p-value = 0.003607


Dann kommst Du allerdings auf 6 Tests und musst langsam anfangen Dir Gedanken um eine Alpha-Fehlerkorrektur zu machen.

LG,
Bernhard
----
`Oh, you can't help that,' said the Cat: `we're all mad here. I'm mad. You're mad.'
`How do you know I'm mad?' said Alice.
`You must be,' said the Cat, `or you wouldn't have come here.'
(Lewis Carol, Alice in Wonderland)
bele
Schlaflos in Seattle
Schlaflos in Seattle
 
Beiträge: 5928
Registriert: Do 2. Jun 2011, 23:16
Danke gegeben: 16
Danke bekommen: 1403 mal in 1389 Posts

Re: Signifikanz aus Anzahl

Beitragvon Stefanie » So 22. Mär 2015, 17:44

Wow,
ich muss zugeben, dass allein zu Sehen, welche möglichen Analysen ich machen kann, mich überfordern. Ich habe gerade einen Termin bei einer Statistikberatung gemacht habe. Ich bin mir ziemlich sicher, dass ich ohne Hilfe nur mathematischen Mist veranstalten werde. :cry:


Trotzdem 1000x Dank für die schnellen Antworten und ich werde natürlich meine letztlich verwendeten Analysen hier präsentieren :P
Stefanie
Grünschnabel
Grünschnabel
 
Beiträge: 4
Registriert: Fr 20. Mär 2015, 14:43
Danke gegeben: 0
Danke bekommen: 0 mal in 0 Post

Re: Signifikanz aus Anzahl

Beitragvon Stefanie » Di 24. Mär 2015, 14:15

Sooooo...
Ich war gerade bei der Statistikberatung :)
Der Tip mit dem Chiquadrattest war genau richtig. Und da ich jetzt weiß, wie dieser Test in (einschlägigen) Statistikprogrammen angewendet wird, habe ich jetzt meine Analysen :D
Stefanie
Grünschnabel
Grünschnabel
 
Beiträge: 4
Registriert: Fr 20. Mär 2015, 14:43
Danke gegeben: 0
Danke bekommen: 0 mal in 0 Post

Re: Signifikanz aus Anzahl

Beitragvon bele » Di 24. Mär 2015, 16:25

Stefanie hat geschrieben:Der Tip mit dem Chiquadrattest war genau richtig.

Na, dann sind wir ja erleichtert. Und wenn es dann auch noch in SPSS geht...
----
`Oh, you can't help that,' said the Cat: `we're all mad here. I'm mad. You're mad.'
`How do you know I'm mad?' said Alice.
`You must be,' said the Cat, `or you wouldn't have come here.'
(Lewis Carol, Alice in Wonderland)
bele
Schlaflos in Seattle
Schlaflos in Seattle
 
Beiträge: 5928
Registriert: Do 2. Jun 2011, 23:16
Danke gegeben: 16
Danke bekommen: 1403 mal in 1389 Posts


Zurück zu Allgemeine Fragen

Wer ist online?

Mitglieder in diesem Forum: Google [Bot] und 8 Gäste

cron