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[0Ahnung]

Hallo allerseits,

ich habe Mengen vieler Proteine zu verschiedenen Zeiten (5 Zeitpunkte) und möchte herausfinden, ob sich die Mengen über die Zeit signifikant ändern.
Die Mengen wurden über massen-spektroskopische Methoden experimentell bestimmt und sind nicht normal verteilt.
Ich würde gerne Ergebnisse der verschiedenen Zeitpunkte über z-score normalisieren, und diese mittel Kruskal Wallis Test auf signifikante Änderung prüfen.
Haltet Ihr das für sinnvoll?

Ich bin für jede konstruktive Kritik äußerst dankbar!

Beste Grüße
0Ahnung

[strukturmarionette]

Hi,

wenn es ich um unterschiedliche (voneinander unabhängige) Merkmalsträger in den Teilgruppen handelt, dann wäre K-W-Test möglich.
Wenn es aber die gleichen Merkmalsträger sind, an denen im Zeitablauf Proteine gemessen werden, dnn kämen eher Tests für abhängige Stichproben in Frage.

Gruß
S.

[0Ahnung]

Vielen Dank strukturmarionette für Deine Antwort,

also ist ein K-W-Test auf Basis von z-score normalisierten Daten möglich?

Nochmals Danke!

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[strukturmarionette]

Hi,

für Messwerte, die nicht die NV-Voraussetzung erfüllen. Das ist nach Deinen Ausführungen der Fall.

z-Score -normalized- ist für mich ein etwas unklarer Oberbegriff.
Ich weiß nicht, wass du dabei wie genau rechnest bzw. transformiert hast.

S.

[0Ahnung]

Für die z-score Normalisierung bilde ich für jedes Protein innerhalb einer Probe den z-score, d.h.:
(Proteinmenge - Mittelwert aller Proteinmengen innerhalb der Probe) / Standardabweichung aller Proteinmengen innerhalb der Probe

Diese Art der Normalisierung hat einen günstigeren Effekt auf den aktuellen Datensatz als z.B. die Mediannormalisierung, die ich sonst nutze.

[strukturmarionette]

Hi,

kann man machen, klar.

massen-spektroskopische Methoden experimentell

Davon vertehe ich nichts. Wahrscheinlich macht diese Transformierung dann irgendwie Sinn.

S.